Nostromo est formé en 1996 à Genève, en Suisse romande. Le nom du groupe s'inspire du Nostromo, un vaisseau de la série des films Alien. Pour Jérôme, « L’idée c’est que ça représente un truc sombre, lointain, cradingue, dans lequel il se passe pleins de trucs laids, donc on estime que c’est assez visuel pour correspondre au nom de groupe. » À ses débuts, Nostromo écume les caves des squats genevois, publiant un premier 45 tours dans le cadre du Club de l'association Post Tenebras Rock (PTR), résidente de l'Usine.
Proche de groupes comme Fragment, Prejudice et Knut avec qui il partage régulièrement l'affiche, Nostromo sort en 1998 son premier album studio, intitulé Argue, sur le label Snuff Records créé par des membres de Knut (actuellement défunt). Taverne quitte le groupe en 1998 pour rejoindre Knut. Il est remplacé par Lad. Les dates s'enchainent, Nostromo se rapprochant du label Overcome Records, basé à Rennes, en France.
L'occasion de se produire lors du Superbowl of Hardcore 99 avec des formations comme Napalm Death, Turmoil et Ananda. L'EP Eyesore, publié sur le label français Mosh Bart Industries (rebaptisé plus tard Bisect Bleep) assoit encore la réputation de Nostromo. Mais c'est l'album complexe et technique Ecce Lex, enregistré en Suède avec Mieszko Talarczyk du groupe Nasum, qui donnera une dimension supplémentaire à Nostromo, devenu une référence du metal extreme et du grindcore.
Le groupe se sépare en 2005. Le guitariste Jéjé jouera dans le groupe Mumakil, Javier officie au sein du groupe Elizabeth, Lad deviendra DJ/producteur de musique électronique, et Maik jouera dans Ostap Bender.
Nostromo se reforme en 2016, après onze ans d'absence, pour accompagner Gojira en tournée.